El Instituto de Ciencias Químicas Aplicadas tiene por misión ser un instituto de excelencia en investigaciones de ciencia básica y aplicada, desarrollando y demostrando en productos la generación de soluciones innovadoras con impacto en la sociedad. Formar capital humano avanzado a través de la investigación y postgrados, de tal manera de ser un aporte en la generación de soluciones efectivas para la sociedad en vinculación con organizaciones pertinentes, tanto a nivel nacional como internacional.

El Instituto de Ciencias Químicas Aplicadas aspira a ser reconocido a nivel nacional entre sus pares, por sus aportes en las investigaciones en el ámbito de las disciplinas que cultiva

• Posicionarse como un instituto científico que aporta al desarrollo local, regional y nacional.
• Promover la generación de conocimiento en todos sus niveles, tanto con recursos propios como externos.
• Desarrollar una red de relaciones colaborativas y multidisciplinarias con instituciones nacionales e internacionales en   pro   de   la   generación   de   conocimiento   y   actividades   relacionadas   con   las investigaciones desarrolladas, que contribuyan a la consolidación del Instituto.
• Contribuir a la creación, preservación y difusión de las Investigaciones desarrolladas ofreciendo oportunidades de formación permanente.
• Permitir y establecer transferencia tecnológica hacia agencias gubernamentales, otras instituciones de investigación e industrias.